В 1941 году, с началом Великой Отечественной войны В. С. Алфеевский работал в «Окнах ТАСС». В послевоенные годы большое место в творчестве художника заняла станковая графика. Он работал чёрной тушью, создавая внутренне законченные, не нуждающиеся в цвете рисунки.
С 1958 года, исчерпав возможности выбранной техники, художник начал использовать цвет. Кроме того, Алфеевский стал меньше внимания уделять деталям и больше — передаче в рисунке общего впечатления от изображаемого. В станковых работах 1950−1960-х годов ещё ярче проявилось новое отношение художника к линии: она стала самостоятельным средством эстетического выражения. Художник стал работать заточенной тростниковой палочкой, и это определило главную особенность рисунка Алфеевского — выразительную линию.
Широкую известность В. С. Алфеевскому принесла деятельность художника-иллюстратора детской книги и особенно в 1950—1970 годы. За годы творчества В. С. Алфеевский проиллюстрировал более чем 150 изданий. В первую очередь это книги для детей — сказки, стихи, рассказы. Сотрудничал с издательствами Детгиз, Гослитиздат, «Советский писатель», «Детская литература», «Художественная литература», «Художник РСФСР», «Молодая гвардия». Книги с иллюстрациями Алфеевского выпускают современные издательства «Ад Маргинем», «Речь», «Эксмо» и другие.
Произведения В. С. Алфеевского — картины, акварели, рисунки, офорты, иллюстрации к детским книгам занимают значительное и уникальное место в нашем искусстве: индивидуальный почерк мастера сформировался в большой степени самостоятельно, вне существенных влияний художественной моды.